Одной из главных проблем стало малоземелье: крестьяне получили наделы значительно меньшие, чем те, которыми пользовались ранее, что вынуждало их арендовать землю у помещиков на невыгодных условиях или уходить на заработки в города. Дополнительно их обременяли высокие выкупные платежи, которые растянулись на десятилетия и стали серьёзной финансовой нагрузкой, мешая развитию хозяйства.

Ситуацию осложняло сохранение общинного землевладения: земля принадлежала сельской общине, которая перераспределяла её между крестьянами. Это ограничивало их хозяйственную инициативу, не позволяя свободно распоряжаться своими участками, продавать их или вкладывать средства в их развитие. Кроме того, низкий уровень агротехники и использование примитивных методов обработки земли значительно снижали урожайность, а новые технологии распространялись медленно из-за нехватки средств.

Помещики, несмотря на реформу, сохраняли влияние, сдавая землю крестьянам в аренду с требованием отработки на барщине, что напоминало старые феодальные порядки и тормозило развитие товарного сельского хозяйства. Также крестьяне практически не имели доступа к кредитам, так как государственные и частные банки в основном обслуживали помещиков и городскую промышленность.