При участии ЭПС происходит сборка мембран для различных нужд клетки: построения наружной мембраны, «ремонта» её повреждения, создания ядерной оболочки пузырьков, цистерн, вакуолей и т. п. Шероховатая ЭПС содержит рибосомы и отвечает за синтез белков и их транспорт к месту использования. Гладкая ЭПС отвечает за синтез жироподобных веществ, половых гормонов, углеводов, обезвреживание некоторых ядовитых веществ. 

Рибосомы отвечают за синтез белка.