При попадании в организм животных или человека вирусов, бактерий или любых чужеродных белков в организме происходит синтез защитных белков — антител, которые обеспечивают гуморальных иммунитет. Кроме того, в ответ на заражение клетки вирусом она вырабатывает специальные белки — интерфероны, которые препятствуют его размножению. Также многие организмы используют для защиты или нападения специфические пептиды и белки, называемые токсинами, которые в большинстве случаев являются сильными ядами.